さすにが、

■さすがに
総当たりなのにHDDに書き出すのはばかばかしいので全部メモリ上でやるように書き換える。といっても数行だけだけど。
ものの数秒で終わった。
ハードディスクとメモリってやっぱり違うな。

ついでに、等高線書くのもプログラム書くのだるいから、mathematicaでトライして、データが大きすぎてだめで、だめもとでgnuplotでやったけどやっぱりうまくいかず、苦肉の策で、awk+gnuplot、というか、awk で描いたといっても過言ではない、ひどい方策をとってなんとか無事達成した。